През 1648 г., Собиески се завръща в Полша и се записва в полската армия срещу бунтовниците на [[Богдан Хмелницки]]. През 1649 е повишен в чин [[полковник]]. Следва назначение в [[Османската империя]] лично от краля [[Ян II Кажимеж]]. Там Ян научава [[Татарски език|татарският език]] и се запознава с турската тактика и военни традиции.
Придобива слава на блестящ военачалник във войната с Швеция (1653 – 1660). През 1665 се жени за [[Мария Кажимера д’Аркиенд'Аркен]] и е назначен за велик коронен маршал ({{lang|pl|marszałek wielki koronny}}) на кралството, а от 1666 година е на длъжността [[хетман|велик коронен хетман]] ({{lang|pl|hetman wielki koronny}}). През 1673 година при [[Хотин]] разбива турските войски. Не успява да завърши победната кампания, тъй като литовските войски под командването на съперника му Михал Пац отказват да участват в кампанията.<ref name=":1">Кратка история на Полша, Йежи Луковски, Хюбърт Завадзки, Труд, София, 2011, с. 111 – 113.</ref> Въпреки това именно еуфорията от хотимската победа осигурява на Собиески и политически успех.<ref name=":1" /> През юни 1674 година е избран за крал на [[Жечпосполита]], а коронацията му се извършва на [[2 февруари]] [[1676]]. [[Файл:King John III Sobieski Sobieski sending Message of Victory to the Pope, after the Battle of Vienna 111.PNG|център|мини|350px|Ян Собиески праща послание за победата до папата след [[Битката при Виена]], 12 септември 1683 г., худ. [[Ян Матейко]]]]
