Село Шипочано се намира в [[северо-източната част на Кюстендилската котловина и на 12км. от гр.Кюстендил, в подножието на планината Риша, която е дял на Конявската планина|планински]].Згушено е между два склона в подходяща уютна котловина, което го предпазва от студените северни районветрове. Изцяло е разположено на юг и това определя мекия климат и винаги слънчевото време.На около километър западно от селото, в низината тече река Струма, току що излязла от Земенско-Ръждавичкия живописен пролом. Тук във нея се влива река Драговищица, извираща от Сърбия.