Село Шипочано се намира в североизточната част на [[Кюстендилска котловина|Кюстендилската котловина]] и на 1214 км. от гр. [[Кюстендил]], в подножието на планината Риша, която е дял на [[Конявската планина]]. Сгушено е между два склона в подходяща уютна котловина, което го предпазва от студените северни ветрове. Изцяло е разположено на юг и това определя мекия климат и винаги слънчевото време. На около половин километър западно от селото, в низината тече река [[Струма]], току що излязла от Земенско-Ръждавичкия живописен пролом. Тук във нея се влива река [[Драговищица]], извираща от [[Сърбия]]. Съседните му села са [[Ръждавица]] - на северозапад на около 3 км, [[Шишковци]] — на югозапад на около 3 км и [[Дворище (Област Кюстендил)|Дворище]] на юг на същото разстояние. Като пътя, който води до село Дворище, продължава и след около общо 6 км се свързва с международния път [[София]] - Кюстендил - [[Скопие]]. До същия път може да се стигне и като се мине в посока село Шишковци и [[Копиловци (Област Кюстендил)|Копиловци]], като този път пресича реката. И в двата варианта разстоянието е едно.
