[[Размножителен период|Размножителният период]] на заека подземник е между февруари и септември. [[Бременност]]та продължава между 28 и 32 дни. Женските раждат 3 до 5 пъти в годината, обикновено по 5-6, в редки случаи до 12 малки. При раждането си малките са напълно безпомощни, на 3-4 седмици започват самостоятелен живот, а на 5-8 месеца достигат [[полова зрялост]].<ref name="ФБ"/>