На [[7 юни]] [[1793]] г. якобинците извършват преврат срещу управлението на жирондинците и установяват контрол върху Конветна и Комитета за обществено спасение. След масовите арести на жирондинци якобинците установяват. т.н. революционна диктатура. През септември 1793 г. доминираният от якобинците Конвент установява управляние на Големия терор, насочен срещу враговете на революцията в страната. Символ на Големия терор става гилотината, жертва на която стават хиляди аристократи, духовници, жирондинци и граждани, заподозрени в реакционна дейност.
По време на тези събития Ебер застава начело на група атеисти, известни като еберисти, които в противовес на [[Деизъм|деизма]] на [[Робеспиер]] пропагандират дехристиянизация на обществото и въвеждане на граждански култ към Разумаразума. Програмата на еберистите е насочена главно срещу католицизма в страната и включва прогонване на част от духовниците, физическото унищожение на други от тях, затварянето на църквите и манастирите, разрушаване на религиозните монументи, въвеждане на граждански култ и церемонии, унищожаване на [[цилобат]]а на монасите, чрез насилствени бракове и забрана на молитвите. Радикалните атеистични възгледи на еберистите обаче не са възприети от якобинците на Робеспиер, които, ръководейки се от своите деистични възгледи, принуждават Конвента да въведе [[Деизъм|деизма]] като официална революционна религия. Така на [[8 юни]] [[1794]] г. Конвентът признава съществуването на върховния Бог.
Реформите на Робеспиер са посрещнати изключително остро от Ебер, който обвинява Робеспиер в посегателство срещу свободата. Същите обвинения Ебер отправя и по отношение на инспирираните от Д[[антонДантон]] реформи. С критиките си Ебер и еберистите застават в полезрението на Ревюлюционния трибунал, в който якобинците обвиняват еберистите в разпуснатост, анархизъм и измяна. Трбуналът първи решава да нанесе удар срещу Еберт и хората му, издавайки през нощта срещу [[13 март]] [[1794]] г. заповед за арестуването на Жак Ебер и неговите поддръжници. След тридневен процес Жак-Рене Едер е осъден на смърт и е гилотиниран [[24 март]] [[1794]] г.
