Повърхностните полизахаиди играят различна ропя в бактериалната [[екология]] и [[физиология]]. Те злужатслужат като бариера между [[клетъчна стена|клетъчната стена]] и обкръважащата среда, опосредстват взаимодействието патоген-гостоприемник, и формират структурния компонент на [[биофилм]]ите. Тези полизахариди се синтезират от [[нуклеотид]]-активирани прекурсори и в повечето случаи всички ензими необходими за синтезата, сглобяването и транспорта на целия полимер са кодирани от гени организирани в отелен клъстер ([[оперон]]), така че да бъдат [[Транскрипция (биология)|транскрибирани ]] групово. [[Липополизахарид]]ите са едни от най-важните за клетъчната повърхност полизахариди, тъй като играят ключова структурна роля за цялостта на външната мембрана, както и за взаимодействието патоген-гостоприемник.
Ензимите изграждащи ''A-band'' (хомополимерни) и ''B-band'' (хетерополимерни) O-антигени са индентифицирани, а метаболитните пътища остановениустановени.<ref>{{cite journal |author=Guo H, Yi W, Song JK, Wang PG |title=Current understanding on biosynthesis of microbial polysaccharides |journal=Curr Top Med Chem |volume=8 |issue=2 |pages=141–51 |year=2008 |pmid=18289083 |doi=10.2174/156802608783378873}}</ref> Екзополизахаридът алгинат, който е линеен ко-полимер на β-1,4-свързани остатъци на D-мануронова киселина и L-гулуронова киселина , е отговорен за микоидния фенотип при късната фаза на заболяването [[муковисцидоза]]. ''pel'' и ''psl'' [[локус]]ите са два наскоро открити генни клъстера, които също кодират екзополизахарид, важен за формирането на биофилма. Рамнолипид е [[сърфактант|биосърфактант]], чиято синтеза е финно регулирана на ниво транскрибция, но точната му роля в заболяването не е установена все още. [[Гликозилиране]]то на протеините [[пипин]] и [[флагелин]] е обект на изследване и е установено, че е отговорен за адхезията и инвазията при бактериална инфекция<ref name=Cornelis>{{cite book | author = Cornelis P (editor). | title = Pseudomonas: Genomics and Molecular Biology | edition = 1st | publisher = Caister Academic Press | year = 2008 | url=http://www.horizonpress.com/pseudo | id = [http://www.horizonpress.com/pseudo ISBN 978-1-904455-19-6 ]}}</ref>
