Учителят джедай Куай-Гон Джин е изпратен на тайна мисия от върховния канцлер Валорум до обсадената планета Набу. Пристигайки на флагманския кораб на Търговската Федерация за среща с вице краля Нют Гънрей корабът му е унищожен и той заедно с ученика си Оби Уан Кеноби слиза на планетата над която вече се "изсипва" инвазията на дроидната армия на федерацията. Срещайки странното местно същество Джар Джар Бинкс минават през подводната столица на Гунганите(оригиналната раса на Набу). Следвайки своя принцип за "Живата Сила" Куай-Гон и Оби Уан спасяват Джар Джар от наказание и го взимат със себе си. Пристигайки в Тиид(столицата на Набу) той решава да ескортира владетелката кралица Амидала до КорускантКорусант за съвещание на Галактическият Сенат. Но при преминаването през блокадата Хипер-двигателят им е повреден и те се принуждават да кацнат на Татуин - свят на робство и мизерия в който Републиката не съществува. В търсенето на липсващите части групата се среща с малко момче на име Анакин Скайуокър което е роб на Тойдарианецът Уато който държи магазин за резервни части. Куай-Гон веднага разпознава в това малко момче "Избраният" от старо джедайско предсказание. Тестовете за Мидихлоринитемидихлорините показва нещо невиждано досега и тогава Джин се убеждава в своето предположение. След серия рисковани залагания момчето спечелва Голямото Състезание и спечелвапечели свободата си както и частите за кораба на новите си приятели. Куай-Гон обаче не подозира, че блокадата и много други неща са дирижирани от тъмният Ситски лорд Сидиъс който праща своя ученик Дарт Моул да се справи с джедайтеджедаите. В първата битка между Моул и Кай-Гон няма победител. При пристигането на КорускантКорусант момчето Скайуокър е отведено в Храма на ДжедайтеДжедаите за да премине тестовете учителите от съвете обаче отказват момчето да бъде обучено независимо от упоритостта на Куай-Гон. Новата задача на Джин е да ескортира кралицата до Набу. При пристигането им Падме Амидала решава, че е време за ответен удар. Тя се съюзява с Бос Нас - водача на Гунганите и подготвят обща контра-атака. При проникването в Тиид в хангара на двореца се натъкват на Дарт Моул - страшен и подготвен за битката на живота си. Двамата джедаи се изправят заедно срещу сита и битката им се разгръща, Моул нарочно ги води към основния генератор за електричество. Тук се оказва и лобното място на учителя джедай Куай-Гон Джин. След дълга и изморителна битка при енергийните прегради на генератора Оби и Куай-Гон се разделят. Тук джедая който вече е на възраст, не успява да устои на мощта на младият Сит и е покосен с два удара - един в коляното и един в гръдният кош. Неговият падуан успява да разсече Моул на две части. Поемайки своя учител в ръце с предсмъртните си думи му казал да обучи Анакин на всяка цена, защото "той е избрания" след което великият джедай издъхва в ръцете на Оби Уан Кеноби. Погребението му се състои на Набу където присъстват Падме Амидала, Бос Нас, Оби Уан, Анакин, и целият върховен съвет на Джедайте както и ново-избраният канцлер Палпатин.!.
