На [[21 ноември]] [[1939]] г. корабаткорабът излиза на поход към района между [[Исландия]] и [[Фарьорски острови|Фарьорските острови]]. На следващия ден, по време на щорм с приблизителна сила 8 бала, от строя излизат няколко оръдия и прожектора. Бойното кръщение на крайцера е на [[23 ноември]], когато заедно с „[[Гнайзенау (линеен крайцер)|Гнайзенау]]“ в скоротечен бой потопяват спомагателния крайцер „[[Равалпинди]]“ (южно от Исландия). При оръдейната стрелба „Шарнхорст“ изстрелва 89 283-милиметрови и 109 150-милиметрови снаряда. Самият крайцер получава попадение от 152-милиметров снаряд в кърмата, а също така и леки повреди от осколки. Опасявайки се от среща с превъзхождащите ги сили на британския флот и използвайки лошото време, немските кораби се оттеглят в [[Норвежко море]], а след това се прибират в [[Хелголандски залив|Хелголандския залив]] ([[27 ноември]]) за поправки. На „Шарнхорст“ е извършен и ремонт на котлите.
Англичаните не се примиряват с това, че са изпуснали немските [[рейдер]]и и на [[17 декември]] предприемат бомбардировка над доковете на Вилхелмсхафен. В продължение на 8 минути „Шарнхорст“ води неефективен огън със своите зенитни оръдия (пречат крановете и зданията на корабостроителниците), но се измъква без щети. Нападението е отбито от [[Месершмит]]и, които свалят 10 от общо 24-те британски [[Викерс Уелингтън|Уелингтън]].
