Манастирът е основан от монаха Герман по времето на [[Стефан Душан]] в средата на 14 век.,<ref>{{Снегаров-ИОА-2|444-445}}</ref> както свидетелства надписът, разположен отвън над входа на южната стена. Манастирът има две големи църкви - „[[Свето„Свето Преображение (Зързе)|Свето Преображение]]“Господне“ от XIV и „Свети Петър и Павел“ от XVII век.<ref name="Old Prilep"/> Освен това, към него принадлежат и по-малките „Свети Илия“ и „Свети Никола“. Към манастирския комплекс принадлежат и кулата на камбанарията, конаци и различни помощни сгради.<ref name="Old Prilep"/> Остатъците от стари градежи показват, че площта на манастира е била много по-голяма в миналото и той е имал много повече сгради. Цялото простраство е било обхванато във единна фортификацонна система на високи и масивни стени и отбранителни кули, от които днес са запазени остатъци.<ref name="Old Prilep"/> Манастирът е епископска катедра на секретаря на Светия архиерейски синод на Македонската православна църква епископ [[Климент Хераклейски]].<ref name="Old Prilep">{{Цитат уеб | уеб_адрес =http://www.oldprilep.com/prilepska-crkovna-opstina/sveto-preobrazenie-zrze.html | заглавие =Манастир „Свето Преображение“, село Зрзе | достъп_дата = 9 март 2014 г | фамилно_име = | първо_име = | дата = | труд = | издател =Old Prilep | език = | цитат = }}</ref>
