Във и около Долно Дупени има 11 църкви. „[[Свети Атанасий (възрожденска църква в Долно Дупени)|Свети Атанасий]]“ е възрожденска църква от 1864 година, изградена върху по-стара от 17 век. „[[Света Богородица (Долно Дупени)|Света Богородица]]“ е манастирска църква на 2 километра североизточно от селото от началото на 20 век. „[[Свети Архангел Михаил (Долно Дупени)|Свети Архангел Михаил]]“ (18941883) е разположена в селото. Живописта е запазена само в апсидата, а църквата има регистрирани като паметници на културата икони. За разположената югоизточно от селото „Свети Илия“ се предполага, че е градена върху по-стара църква. Скромната по размери „Свети Врачи“ е на 3-4 километра източно от селото. „Свети Никола“, на 1 km източно, също е малка със скромна архитектура. Такива са и разположената на 1 km южно „Свети Димитър“, разположената на изток „Света Петка“ и на югоизток „Свети Филип“. „[[Св. св. Кирил и Методий (Долно Дупени)|Св. св. Кирил и Методий]]“ е селска църква от 1911 година. „[[Свети Атанасий (късносредновековна църква в Долно Дупени)|Свети Атанасий]]“ е от поствизантийския период.<ref name="visitpelagonia.mk">{{Цитат уеб | уеб_адрес = http://www.visitpelagonia.mk/index.php?option=com_content&view=category&layout=blog&id=75&Itemid=53&lang=mk | заглавие = Цркви | достъп_дата = 28 февруари 2014 г | фамилно_име = | първо_име = | дата = | труд = visitpelagonia.mk | издател = | език = | цитат = }}</ref>
