ОщеПрез 1469 приживегодина на своя(когато баща, му Хуан II Арагонски,Фернандое през 1469още годинажив), Фернандо се жени за Исабела, наследницатогава принцеса, (а следпо-късно товаи [[Крал на Кастилия|кралица на Кастилия]],. и следСлед смъртта на Хуан (II през 1479 г.) Фернандо застава начело на дведвете най-силни кралства на полуострова: - Арагон и Кастилия. За Кастилия съпрузите водят жестока борба с [[Крал на Португалия|португалския крал]], заявил претенции от иметопретенциите на своята племенница Хуана, дъщеря на по-големия брат на Исабела — Хуана, коятос подозират в товааргумента, че тяИсабела е роденадъщеря не отна краля, а отна любовника на кралица Белтрана де ла Куева;. борбатаКонфликтът свършвазавършва (през 1476-та година) с поражение на Португалия.
При управлението на Фернандо и Исабела е превзето последното мюсюлманско владение на [[Пиренейски полуостров|Пиренейския полуостров]] и завършва насилствената християнизация на мюсюлманите и евреите в страната, което донася на двамата прозвището ''Католическите крале''.
Фернандо II умира на [[23 януари]] [[1516]] година в [[Мадригалехо]] и е наследен от дъщеря си Хуана безумната (или лудата), която управлява заедно със своя син Карлос I (още [[Карл V]] ).