На 14-ти април, 1202 съпругът иѝ я оставя във Фландрия и се присъединява към [[Четвърти кръстоносен поход|Четвъртия кръстоносен поход]] . Този кръстоносен поход е отклонен към Константинопол , столицата на Византийската империя. Кръстоносците превземат и плячкосват града. Тогава решават да създадат ЛатинскаЛатинската империя , на мястото на падналата гръцка. На 9 май 1204 г., Балдуин е избран за първи император , Мария за императрица.
Жофроа Вилардуен твърди, в хрониката си ,че след раждането на второ си дете, Мария изчаква да се възстанови, и тръгва да се присъедини към мъжа си.
Тя отплава от пристанището Марсилия с фламанскатафламандската флота на Жан Несле, синьор на Брюж и се пристига в Aкра през пролетта на 1203 г.. Бoемонд IV ,княз на Антиохия я посреща. През 1204 г. в [[Акра (Израел)|Акон]] научава, че нейният съпруг, след завладяването на [[Константинопол]] през май 1204 г., е избран за новия латински император на Източната империя.Тя иска да отплава за Константинопол, но се разболява и умира в Светите земи след кратко боледуване, без да стъпи в нейната империя. .
Новината за смъртта йѝ достига Константинопол чрез кръстоносците, които идват за подкрепления от Сирия . Болдуин е наскърбен от смъртта на съпругата си. Вилардуен съобщава, че Мария "беше милостива и добродетелна дама".
