Чепеларска река води началото си от 1 550 мm н.в. в курорта „[[Пампорово]]“. От извора си до село [[Хвойна (село)|Хвойна]] тече на север, след това до село [[Бачково]] – на североизток, а след селото и до устието си – отново на север. От извора до град [[Асеновград]] протича в тясна, дълбока и красива долина, по която има две малки долинни разширения – в районите на град [[Чепеларе]] и село [[Хвойна (село)|Хвойна]]. След [[Асеновград]] реката навлиза в [[Горнотракийска низина|Горнотракийската низина]], където коритото ѝ става широко и песъчливо и от него наляво и надясно се отделят напоителни канали. Влива се отдясно в река [[Марица]] на 148 m н.в., на 2,5 km южно от село [[Рогош]], [[Община Марица]].
