От 1899 г. е началник на 1-ва Източносибирска стрелкова бригада. [[Генерал-майор]] (1899).
През време на Китайската кампания (1900-1901 г.), от юли 1900 г. генерал-майор Флейшер е назначен за началник на Южноманджурския отряд. След 3-дневен бой (28, 29 и 30 юли 1900 г.), въпреки силния отпор, войските от Южноманджурския отряд разбиват [[китайци]]те (състоящи се от около 4 хил. войници, хиляда въстанницивъстаници и 8 оръдия), и превземат гр. Хайчен, превземайки междувременно и 6 оръдия. Китайците се изтеглят към Ляоян. След превземането на Пекин на 14 август 1900 г., Южноманджурския отряд получава заповед за настъпление по линията Мукден - Ляоян, като тази операция е възглавена от генерал-лейтенант Деан Иванович Субботич, като на него са подчинени всички войски, намиращи се в Южна [[Манджурия]]. Ген. Субботич издава заповед за настъпление и така на 11 септември създава три колони — лявата с командир генерал-майор Флейшер, в ценъра колона с командир полковник Леонид Константинович Артамонов, в дясно колона с командир полковник Павел Иванович Мищенко (Мишченко). Китайските сили се разполагат в две групи: 6000 в гр. Нючжуан и 16000 в гр. Айсяндзаня. На 11 септември 1900 г. настъпващият авангард под командването на генерал-майор Флейшер, след непродължителна престрелка, превзема гр. Стари Нючжуан. На 15 септември 1900 г. предните части от колоната, командвана от генерал Флейшер, превземат гр. Ляоян. На 18 септември се провежда продължително настъпление към Мукден и на 19 септември 1900 г. Мукден бива превзет. По собствено желание ген. Субботич се уволнява от поста командир на Южноманджурския отряд на 26 октомври 1900 г. На негово място е назначен генерал-майор Константин Викентиевич Церпицкий. През август 1901 г. генерал-лейтенант Церпицкий предава командването на Южноманджурския отряд на генерал-майор Флейшер.
През 1902 г. ген. Флейшер е назначен на разположение на началника на Руския Главен щаб. На 23 април същата година - за възстановяването на спокойствието в Манджурия след потушаването на Боксерското въстание от 1898-1901 г. е удостоен с китайския орден на Двойния Дракон. От 10 февруари 1903 г. до 10 август 1904 г. е началник на 20-та пехотна дивизия.
