Пирин не е особеномного водна планина. Въпреки това тяТя дава началото на някоиголям брой реки, които принадлежат към водосборните басейни на [[Струма]] и [[Места]]. Те са сравнително къси, буйни и пълноводни, с голям наклон, поради което по тях се образуват множество водопади, прагове и бързеи. Има няколко по-изявени водопада – [[Влахински водопад|Влахинският водопад]], [[Скоко (водопад)|Скоко]], [[Попинолъшки водопад|Попинолъшкият]] (15 м), Демянишки скок (11 м) и Юленски скок (9 м). Вододелът между водосборните басейни на Струма и Места минава по централното пиринско било. Пиринските реки имат снежно-дъждовен режим със силно изразен пролетен максимум.
