В следосвобожденския период идеята за Балканска федерация е много тясно обвързана с [[Македонски въпрос|Македонския въпрос]], който е част от по-големиятголемия Източен въпрос. Тя често се предлага като решение на Македонския въпрос, присъства в повечето програми на [[ВМОРО]], привърженици на идеята са голяма част от видните дейци на организацията начело с [[Гоце Делчев]]. След [[Илинденско-Преображенското въстание]] от 1903 г. и разцеплението на ВМОРО под напора на засилените процеси на деградация вътре в организацията и най-вече поради засилващото се влияние на левите идеи, се появява ляво течение на ВМОРО начело с [[Яне Сандански]], А след [[Младотурската революция]] се основава и [[Народна федеративна партия (българска секция)|Народната федеративна партия]], която изпраща двама депутати в [[Османски парламент|Османския парламент]], единият от които е [[Димитър Влахов]], започва издаването и на сп. „Балканска федерация“ във [[Виена]], който става орган на лявото крило на ВМОРО.
