Йоан Дзиндзифи е роден в град [[Битоля]], тогава в Османската империя. Според [[Кузман Шапкарев]] е с [[арумъни|влашки]] произход, но самият Жинзифов отрича влашка принадлежност.<ref name="Шапкарев 399"/> Първоначалното си образование получава в местно гръцко училище, след това сезавършва школувамедицина в [[АтинаАтински университет|Атинския университет]]. На 14 май 1831 година става студент в [[Лайпцигски университет|Лайпцигския университет]] със специалност медицина. През 60-те години на XIX век става учител в гръцкото училище в [[Прилеп (град)|Прилеп]], а по-късно учител в първото българско училище в [[Битоля]].<ref>{{cite book |title= Българската възрожденска интелигенция (енциклопедия) |last= |first= |authorlink= |coauthors= |year=1988 |publisher=Държавно издателство „Д-р Петър Берон“ |location=София |isbn= |pages= 243 - 244|url= |accessdate= |quote= }}</ref>
В едно писмо до професор [[Михаил Погодин]] от 1868 година Йоан Дзиндзифи пише:
