ChEBI е химическа база данни и онтология на молекулярни единици, фокусирани върху „малки“ химични съединения. ChEBI е абревиатура от Chemical Entities of Biological Interest (в превод: химични единици от биологичен интерес).[1] Базата данни е част от работата на Европейския институт по биоинформатика (European Bioinformatics институт или EBI).

Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI)
Уеб адресwww.ebi.ac.uk/chebi
Тип на сайтабаза данни
Регистрацияне
Езикen
ПритежателЕвропейска лаборатория за молекулярна биология
Създаден отЕвропейска лаборатория за молекулярна биология
Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) в Общомедия

Терминът „молекулярна единица“ се отнася до всеки „конституционално или изотопно различен атом, молекула, йон, йонна двойка, радикал, радикален йон, комплексно съединение, конформер и т.н., които могат да бъдат идентифицирани като самостоятелно разграничима единица“.[2] Въпросните молекулярни единици могат да бъдат или естествени, или синтетични продукти, които имат потенциална биоактивност. Молекули, директно кодирани от генома, като нуклеинови киселини, протеини и пептиди, получени от протеини чрез протеолитично разцепване, като правило не са включени в ChEBI. ChEBI използва номенклатура, символи и терминология, одобрени от Международния съюз за чиста и приложна химия (IUPAC) и комитета по номенклатура на Международния съюз по биохимия и молекулярна биология (NC-IUBMB).

Обхват и достъп

редактиране

Всички данни в базата данни са непатентовани или са получени от непатентован източник, което ги прави свободно достъпни за всеки. В допълнение, всяка единица от данни е напълно проследима и изрично препраща към оригиналния източник. По обхват е свързана с други бази данни като ChEMBL, ChemSpider, DrugBank, MetaboLights и PubChem.

Данните на ChEBI са достъпни чрез публично уеб приложение, уеб услуги, SPARQL крайна точка и за сваляне.[1]

Източници

редактиране
  1. а б ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest // Nucleic Acids Research 36 (Database issue). 2008. DOI:10.1093/nar/gkm791. с. D344-50.
  2. IUPAC, Compendium of Chemical Terminology, 2nd ed. (the "Gold Book") (1997). Online corrected version:  (2014) "molecular entity".
    Тази страница частично или изцяло представлява превод на страницата ChEBI в Уикипедия на английски. Оригиналният текст, както и този превод, са защитени от Лиценза „Криейтив Комънс – Признание – Споделяне на споделеното“, а за съдържание, създадено преди юни 2009 година – от Лиценза за свободна документация на ГНУ. Прегледайте историята на редакциите на оригиналната страница, както и на преводната страница, за да видите списъка на съавторите. ​

ВАЖНО: Този шаблон се отнася единствено до авторските права върху съдържанието на статията. Добавянето му не отменя изискването да се посочват конкретни източници на твърденията, които да бъдат благонадеждни.​